火影忍者手游中关于造人与长生不老的设定主要来源于原作动漫的经典剧情移植。游戏内大蛇丸的科研线完整还原了其通过禁术不尸转生实现精神转移的永生方式，该术需以活人为容器，每三年更换一次身体。蝎的人傀儡改造术也被复刻为游戏机制，玩家可通过再生核系统维持角色永久战斗状态。这两种核心玩法均需消耗特殊道具秽土之魂或傀儡核心，在实验室界面完成合成。
长生不老体系在游戏中体现为特殊状态加成。角都的地怨虞秘术允许玩家储存五颗心脏作为额外生命值，通过击败特定副本BOSS获取心脏部件。仙人模式则提供时效性无敌效果，开启后持续消耗查克拉但免疫所有伤害，需在妙木山副本收集自然能量激活。游戏对原作中飞段的不死设定做了平衡性调整，仅保留其伤害共享机制，实际仍会受到致命伤害。
关于人造人系统，音忍村实验室可培育巳杯、巳月等特殊角色。该玩法需要集齐大蛇丸的基因样本、咒印碎片等材料，通过培养槽进行为期七天的合成。成品角色自带人工生命标签，拥有专属连招科学忍具组合技，但无法参与部分PVP模式。游戏在此处严格遵循原作设定，人造角色存在情感培养度数值，需定期完成羁绊任务维持稳定性。
游戏将长生不老转化为具体战斗策略。秽土转生忍者拥有无限复活被动技能，但每次复活会削弱20%属性；百豪之术提供持续回血效果，代价是降低50%防御力。玩家需在不死性与战斗效能间寻找平衡，例如蝎的傀儡形态虽无视时间衰减，但会被雷遁技能额外克制。这些设计使得永生机制既保留原作特色，又符合游戏平衡需求。
长生类技能普遍需要消耗生命结晶，可通过丰饶之间副本、组织商店兑换获取。人造角色培养则依赖实验经费货币，需完成大蛇丸的委托任务积累。游戏通过资源限制机制，将原作中近乎bug的永生能力转化为需要持续投入的长期玩法，这种设计既还原了设定又避免了破坏游戏经济系统。
